121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0824 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  100 
 
 
321 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  41.61 
 
 
321 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  38.96 
 
 
316 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  39.56 
 
 
327 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  37.58 
 
 
321 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  38.76 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  38.26 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  38.41 
 
 
322 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  37.94 
 
 
321 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  37.58 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  38.54 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  39.81 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  37.62 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  40.97 
 
 
321 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  37.91 
 
 
326 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  38.36 
 
 
326 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  37.58 
 
 
326 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  38.83 
 
 
321 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  38.06 
 
 
326 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  38.24 
 
 
321 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  35.78 
 
 
324 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  36.31 
 
 
326 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  37.78 
 
 
321 aa  186  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  37.62 
 
 
326 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  36.62 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  35.58 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  38.29 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  33.86 
 
 
316 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  37.3 
 
 
320 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  35.81 
 
 
310 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  35.81 
 
 
310 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  39.68 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  33.86 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  38.46 
 
 
321 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2622  homoserine kinase  38.71 
 
 
321 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  37.12 
 
 
319 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  35.39 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  34.73 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  34.73 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  38.59 
 
 
320 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  37.54 
 
 
321 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1713  homoserine kinase  32.3 
 
 
325 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  33.23 
 
 
318 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  36.42 
 
 
320 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  36.89 
 
 
308 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  36.81 
 
 
329 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  35.29 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  32.59 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  36.81 
 
 
329 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  34.45 
 
 
328 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  32.92 
 
 
324 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  33.23 
 
 
328 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  33.24 
 
 
348 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  31.76 
 
 
323 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2627  homoserine kinase  33.44 
 
 
328 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  32.31 
 
 
332 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0870  homoserine kinase  33.75 
 
 
330 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649972  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  31.69 
 
 
331 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  31.82 
 
 
320 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  34.17 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6795  homoserine kinase  31.45 
 
 
331 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  decreased coverage  0.0000000680635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  31.58 
 
 
332 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  33.43 
 
 
331 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  35.29 
 
 
316 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  33.44 
 
 
334 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0307  homoserine kinase  32.31 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0859  homoserine kinase  32.31 
 
 
348 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  32.72 
 
 
332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  32.72 
 
 
332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1486  homoserine kinase  32.31 
 
 
348 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.873158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1682  homoserine kinase  32.31 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2556  homoserine kinase  32 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2419  homoserine kinase  32.31 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937902  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0338  homoserine kinase  32.31 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.391807  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  32.72 
 
 
332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  35.06 
 
 
316 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  30.96 
 
 
332 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4878  homoserine kinase  32.11 
 
 
332 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712045  hitchhiker  0.000852558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  31.45 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  35.81 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0136  homoserine kinase  35.44 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  36.01 
 
 
316 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5107  homoserine kinase  34.43 
 
 
316 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.171443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0121  homoserine kinase  35.44 
 
 
316 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  34.26 
 
 
317 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0138  homoserine kinase  34.1 
 
 
316 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60387  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1146  homoserine kinase  33.86 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16142  normal  0.462949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  30.94 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  31.25 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6296  homoserine kinase  34.16 
 
 
316 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72510  homoserine kinase  33.81 
 
 
316 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  27.94 
 
 
413 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2067  homoserine kinase  28.82 
 
 
391 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2390  homoserine kinase  28.19 
 
 
389 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.581306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  26.8 
 
 
322 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  26.97 
 
 
323 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  26.46 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  26.46 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  24.28 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  24.48 
 
 
528 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>