134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0612 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  100 
 
 
321 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  94.39 
 
 
327 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  76.49 
 
 
326 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  77.36 
 
 
321 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  67.29 
 
 
322 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  65.83 
 
 
326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  65.11 
 
 
326 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  65.11 
 
 
326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  61.88 
 
 
321 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  62.11 
 
 
327 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  62.38 
 
 
326 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  60.31 
 
 
321 aa  411  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  60.5 
 
 
321 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  60.94 
 
 
326 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  60.06 
 
 
321 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  60.75 
 
 
326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  60.94 
 
 
326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  59.12 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  60.19 
 
 
326 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  63.95 
 
 
326 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  60.31 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  60.19 
 
 
321 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  57.05 
 
 
319 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  57.32 
 
 
321 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2622  homoserine kinase  59.12 
 
 
321 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  58.49 
 
 
329 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  58.49 
 
 
329 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  55.49 
 
 
321 aa  346  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  52.09 
 
 
320 aa  332  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  49.84 
 
 
320 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  46.35 
 
 
328 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  47.74 
 
 
320 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  40.13 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  38.34 
 
 
316 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  39.68 
 
 
319 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  40 
 
 
321 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  38.64 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  38.64 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  38.96 
 
 
324 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0870  homoserine kinase  38.44 
 
 
330 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649972  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  37.85 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  37.85 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  37.85 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  39.1 
 
 
318 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  37.85 
 
 
332 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  38.91 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6795  homoserine kinase  38.61 
 
 
331 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  decreased coverage  0.0000000680635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4878  homoserine kinase  37.5 
 
 
332 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712045  hitchhiker  0.000852558 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  37.5 
 
 
332 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  37.2 
 
 
332 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2627  homoserine kinase  36.81 
 
 
328 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  37.93 
 
 
331 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  38.34 
 
 
310 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  38.34 
 
 
310 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  37.34 
 
 
323 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  37.3 
 
 
316 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  36.71 
 
 
331 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1713  homoserine kinase  35.89 
 
 
325 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448075  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  37.69 
 
 
318 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  35.85 
 
 
334 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  35.69 
 
 
324 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  37.94 
 
 
321 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  34.52 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  35.22 
 
 
334 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1486  homoserine kinase  37.03 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.873158  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2556  homoserine kinase  37.03 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2419  homoserine kinase  37.03 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937902  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0307  homoserine kinase  37.03 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1682  homoserine kinase  37.03 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0338  homoserine kinase  37.03 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.391807  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0859  homoserine kinase  37.03 
 
 
348 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  40 
 
 
316 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  35.53 
 
 
334 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  37.58 
 
 
321 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  36.79 
 
 
328 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  35.26 
 
 
320 aa  185  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1146  homoserine kinase  37.69 
 
 
324 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16142  normal  0.462949 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  37.42 
 
 
308 aa  178  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  33.92 
 
 
348 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  35.2 
 
 
316 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  36.45 
 
 
316 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  35.38 
 
 
317 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  35.48 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  35.58 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  34.49 
 
 
331 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0136  homoserine kinase  34.18 
 
 
316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5107  homoserine kinase  33.86 
 
 
316 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.171443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0138  homoserine kinase  34.49 
 
 
316 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0121  homoserine kinase  34.49 
 
 
316 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72510  homoserine kinase  37.82 
 
 
316 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6296  homoserine kinase  38.02 
 
 
316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  26.79 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  27.65 
 
 
334 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  27.21 
 
 
322 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  26.62 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  26.73 
 
 
413 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0084  Homoserine kinase  31 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2067  homoserine kinase  25 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2390  homoserine kinase  25.3 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.581306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  26.6 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>