120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0121 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0121  homoserine kinase  100 
 
 		 316 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0138  homoserine kinase  99.68 
 
 		 316 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0136  homoserine kinase  98.1 
 
 		 316 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5107  homoserine kinase  96.52 
 
 		 316 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.171443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  75.08 
 
 		 317 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  73.42 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  72.78 
 
 		 316 aa  487  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  73.1 
 
 		 316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  66.77 
 
 		 316 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6296  homoserine kinase  71.2 
 
 		 316 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72510  homoserine kinase  70.57 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  46.95 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  46.62 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  42.16 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  42.58 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  42.17 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  44.52 
 
 		 316 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  43.09 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  42.41 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0870  homoserine kinase  42.59 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  42.54 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  41.93 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6795  homoserine kinase  40.69 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  decreased coverage  0.0000000680635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2627  homoserine kinase  41.59 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  41.32 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  40.62 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  41.41 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  41.41 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  42.05 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  41.41 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  42.24 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  41.88 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4878  homoserine kinase  40.49 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712045  hitchhiker  0.000852558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  41.05 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  40.99 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  43 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  39.75 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  36.54 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  40.62 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  40.62 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  40.87 
 
 		 334 aa  211  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  37.67 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0859  homoserine kinase  40.62 
 
 		 348 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0307  homoserine kinase  40.62 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1486  homoserine kinase  40.62 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.873158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1682  homoserine kinase  40.62 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2419  homoserine kinase  40.62 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937902  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0338  homoserine kinase  40.62 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.391807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  40.84 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2556  homoserine kinase  40.69 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  38.73 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  40.45 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  40.45 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  43.87 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  36 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  37.34 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1146  homoserine kinase  40.94 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16142  normal  0.462949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  40.57 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1713  homoserine kinase  37 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  37.74 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  37.66 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  37.26 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  36.2 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  36.01 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  36.22 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  37.42 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  37.9 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  36.88 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  37.58 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  36.1 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  38.91 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  37.58 
 
 		 326 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2622  homoserine kinase  38.99 
 
 		 321 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  39.02 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  37.7 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  38.17 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  36.39 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  37.66 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  37.7 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  37.99 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  36.59 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  37.34 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  34.19 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  34.49 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  34.82 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  37.58 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  32.28 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  35.37 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  34.43 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  34.71 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  34.86 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0084  Homoserine kinase  34.07 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  28.31 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  29.02 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  28.67 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  28.67 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2390  homoserine kinase  27.76 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  27.87 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2067  homoserine kinase  27.14 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  21.66 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>