104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2438 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  100 
 
 		 334 aa  688    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  95.51 
 
 		 334 aa  659    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  88.02 
 
 		 334 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0870  homoserine kinase  71.25 
 
 		 330 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2627  homoserine kinase  69.75 
 
 		 328 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4878  homoserine kinase  69.05 
 
 		 332 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712045  hitchhiker  0.000852558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  67.86 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  69.6 
 
 		 331 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  67.86 
 
 		 332 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  67.86 
 
 		 332 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  67.86 
 
 		 332 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  68.15 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  67.56 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6795  homoserine kinase  68.5 
 
 		 331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  decreased coverage  0.0000000680635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  67.89 
 
 		 331 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  67.58 
 
 		 323 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0859  homoserine kinase  69.21 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1486  homoserine kinase  69.21 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.873158  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2556  homoserine kinase  69.42 
 
 		 331 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2419  homoserine kinase  69.51 
 
 		 331 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937902  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0307  homoserine kinase  69.21 
 
 		 331 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1682  homoserine kinase  69.21 
 
 		 331 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0338  homoserine kinase  69.21 
 
 		 331 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.391807  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1713  homoserine kinase  58.39 
 
 		 325 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448075  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  57.63 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  61.18 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  59.69 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  57.94 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  57.94 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  58.7 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  57.19 
 
 		 331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  55.45 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  54.3 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  54.37 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1146  homoserine kinase  58.26 
 
 		 324 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16142  normal  0.462949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  60.31 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  50.31 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  45.96 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  44.1 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  43.03 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  41.12 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  41.12 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  41.25 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  38.61 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  39.88 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  36.02 
 
 		 320 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  38.23 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  41.38 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5107  homoserine kinase  40.81 
 
 		 316 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.171443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  38.63 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0121  homoserine kinase  40.62 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  41.38 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0138  homoserine kinase  40.62 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  37.69 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  39.51 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0136  homoserine kinase  40.31 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  38.41 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  36.84 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  39.51 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  35.85 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  38.32 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72510  homoserine kinase  42.01 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  37.19 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  38.44 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  33.96 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  39.25 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  37.46 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  37.35 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  36.84 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  35.22 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  36.96 
 
 		 321 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  37.72 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  36.65 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6296  homoserine kinase  41.43 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  36.28 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  36.84 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  35.58 
 
 		 326 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  35 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  36.42 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  35.76 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  33.33 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  34.95 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  35.8 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2622  homoserine kinase  37.04 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  37.04 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  37.04 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  29.52 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  33.12 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  32.31 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  31.25 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  32.4 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  28.43 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2390  homoserine kinase  28.43 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581306 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2067  homoserine kinase  28.99 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0084  Homoserine kinase  31.86 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  29.18 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  28.85 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  28.52 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  25.78 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  25.57 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>