116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2691 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  100 
 
 		 320 aa  651    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  57.88 
 
 		 320 aa  342  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  55.31 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  53.99 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  55.19 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  51.78 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  54.05 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  53.21 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  52.75 
 
 		 321 aa  318  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  53.57 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  52.27 
 
 		 326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  52.4 
 
 		 326 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  51.44 
 
 		 326 aa  311  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  52.41 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  49.84 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  52.88 
 
 		 329 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  50.16 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  52.88 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  52.1 
 
 		 321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  51.95 
 
 		 326 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  49.2 
 
 		 327 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  50.48 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  50.16 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2622  homoserine kinase  52.24 
 
 		 321 aa  298  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  51.46 
 
 		 321 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  50.64 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  48.22 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  52.1 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  50.64 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  49.84 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  48.87 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  48.08 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  37.58 
 
 		 317 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  38.17 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  35.48 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  35.19 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  36.71 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  35.19 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  34.29 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  33.66 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  34.08 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  35.81 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  37.74 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  36.42 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  37.74 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  37.74 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  33.44 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  34.21 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  33.33 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  37.13 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  37.19 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1713  homoserine kinase  31.15 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  34.37 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  33.03 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  36.69 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  32.19 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  36.36 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1146  homoserine kinase  34.18 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16142  normal  0.462949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  34.64 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72510  homoserine kinase  38.43 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  32.62 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  35.03 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2627  homoserine kinase  31.65 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6296  homoserine kinase  38.08 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5107  homoserine kinase  35.17 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.171443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  32.15 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  32.31 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0121  homoserine kinase  34.38 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  34.19 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0136  homoserine kinase  35.17 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0870  homoserine kinase  32.81 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0138  homoserine kinase  34.03 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  30.91 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  30.19 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  30.16 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  30.16 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  30.16 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  30.49 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  30.91 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  32.04 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  29.84 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4878  homoserine kinase  29.52 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712045  hitchhiker  0.000852558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6795  homoserine kinase  30.19 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  decreased coverage  0.0000000680635 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2556  homoserine kinase  29.57 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0859  homoserine kinase  29.57 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0307  homoserine kinase  29.57 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1486  homoserine kinase  29.57 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.873158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1682  homoserine kinase  29.57 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2419  homoserine kinase  29.57 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937902  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0338  homoserine kinase  29.57 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.391807  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  29.11 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  28.08 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  27.74 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  27.53 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  27.1 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  25.25 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2067  homoserine kinase  24.26 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2390  homoserine kinase  23.93 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  24.56 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  23.65 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>