116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0292 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 337 aa  706    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  27.44 
 
 		 528 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  31.06 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  26.95 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  26.28 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  26.14 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  27.42 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  26.6 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  28.18 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  25.94 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  28.12 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  25.26 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  26.26 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  26.26 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  25.09 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  24.03 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  25.42 
 
 		 327 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  24.34 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  25.5 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  25.46 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  27.65 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  25.66 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  23.91 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  24.19 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  24.5 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  25.84 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  23.91 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  24.28 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  24.71 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4878  homoserine kinase  25.25 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712045  hitchhiker  0.000852558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  25.08 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  24.62 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0870  homoserine kinase  24.14 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  24.73 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0859  homoserine kinase  23.34 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  26.64 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2556  homoserine kinase  23 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0307  homoserine kinase  23 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  25.21 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1682  homoserine kinase  23 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2419  homoserine kinase  23 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937902  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0338  homoserine kinase  23 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.391807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  25.4 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  23.84 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  24.9 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1486  homoserine kinase  23 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.873158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  23.77 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  22.9 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  25.69 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6795  homoserine kinase  24 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  decreased coverage  0.0000000680635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1713  homoserine kinase  25.58 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  24.44 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  23.57 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  23.75 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  23.35 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  21.65 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  24.19 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  24.45 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  22.54 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  24.26 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  23.57 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  24.26 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  24.54 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  24.26 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  24.91 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  21.8 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  20.98 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  24.61 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  26.15 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  21 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  25.66 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  26.2 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  23.93 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  23.98 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  23.93 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  25 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  24.55 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  22.8 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  25 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  25.13 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  20 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  25.93 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  25.64 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  20 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  20 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  23.71 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  25.13 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  19.51 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  22.58 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  25.51 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  23.41 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  25.94 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2627  homoserine kinase  26.41 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  24.75 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0084  Homoserine kinase  24.54 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  22.4 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1456  serine/threonine protein kinase  22.07 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>