117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3344 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  41.7 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  39.61 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  36.82 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  29.56 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  32.72 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  33.1 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  31.68 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  31.68 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  31.68 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  32.67 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  32.36 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  26.1 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  24.71 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0435  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  29.39 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  24.8 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  29.39 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  20.7 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  29.86 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0540  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  28.16 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  20.49 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  19.79 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1456  serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  30.36 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  19.78 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  21.74 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  27.95 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  22.7 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  23.17 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  29.28 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  27.47 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  28.06 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  27.85 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  19.41 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  27.82 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  19.41 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  21.5 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  27.73 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  23.35 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 		 351 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  26.41 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  28.34 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  22.97 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1613  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  27.16 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  24.35 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  24.25 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  27.12 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  26.36 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  22.63 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3619  serine/threonine protein kinase  18.64 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  24.35 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  25.19 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 		 342 aa  45.8  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  28.43 
 
 		 316 aa  45.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  27.68 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  29.01 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  30.34 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  29.07 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  26.59 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  24.54 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  35.37 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  39.02 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  22.16 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  22.16 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  34.62 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  28.19 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  27.96 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>