69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2123 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
322 aa  638    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  70.72 
 
 
346 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  53.97 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  53.97 
 
 
330 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  51.85 
 
 
330 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  51.85 
 
 
330 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  51.85 
 
 
330 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 
333 aa  295  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  47.48 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  45.02 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  44.84 
 
 
336 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  41.38 
 
 
335 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  43.65 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  45.74 
 
 
379 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  45.73 
 
 
375 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  43.23 
 
 
318 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  38.04 
 
 
347 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 
348 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  38.26 
 
 
339 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  32.42 
 
 
333 aa  125  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  36.22 
 
 
302 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 
339 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  32.88 
 
 
311 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  33.1 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  24.59 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  25.97 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  25.21 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  25.18 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  22.89 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  22.89 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  23.36 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  23.55 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  27.7 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  23.9 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  23.98 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  24.13 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  26.92 
 
 
973 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  23.35 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  25.34 
 
 
975 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  26.01 
 
 
970 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  24.83 
 
 
973 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  20.85 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  20.26 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  24.13 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  24.56 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  27.62 
 
 
981 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  27.62 
 
 
981 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  28.15 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  27.18 
 
 
981 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  26.22 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  23.88 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  24.89 
 
 
1003 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  24.61 
 
 
970 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  19.43 
 
 
319 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  21.64 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  26.38 
 
 
977 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  23.59 
 
 
974 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  25 
 
 
966 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 
327 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28844  predicted protein  24.76 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  24.49 
 
 
967 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  28.05 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1990  protein kinase-like protein  37.93 
 
 
747 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.533031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  21.38 
 
 
323 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>