86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0069 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 335 aa  689    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  64.35 
 
 		 333 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  62.84 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  49.69 
 
 		 336 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  41.38 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  41.09 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  39.37 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  40.25 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  41.28 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  38.94 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  38.94 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  38.94 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  37.73 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  35.92 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  41.22 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  31.68 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  30.12 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  35.08 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  32.03 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  35.15 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  31.66 
 
 		 311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 528 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  26.14 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  22.22 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  23.89 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  23.2 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  25.51 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  28.14 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  24.84 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  26.81 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  27.14 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  27.14 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  23.67 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  27 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  23.4 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  26.6 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  25.09 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  23.75 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  26.03 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  23.37 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  23.67 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  23.67 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  22.94 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  24.74 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  22.34 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  23.67 
 
 		 966 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  20.98 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  20.57 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  24.29 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  24.07 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  26.84 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  23.86 
 
 		 973 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  24.45 
 
 		 976 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  26.27 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3619  serine/threonine protein kinase  22.11 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2760  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  24.51 
 
 		 973 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  22.97 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1456  serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  22.99 
 
 		 976 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  22.81 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  22.42 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  22.22 
 
 		 970 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  25 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  22.82 
 
 		 970 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  25.69 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  45 
 
 		 837 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2086  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2340  protein kinase domain-containing protein  25.71 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  21.86 
 
 		 975 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>