93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3016 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 333 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  50.76 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 		 322 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  46.53 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  46.53 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  41.74 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  41.09 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  44.88 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  41.07 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  43.91 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  38.77 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  38.77 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  38.77 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  39.69 
 
 		 331 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  44.14 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  40.78 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  32.27 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  34.62 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  30.32 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  30.58 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  32.46 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  32.44 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  27.64 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  27.34 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  23.11 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  23.73 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  26.82 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  25.84 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  20.69 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  26.82 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  26.82 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  26.78 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  26.82 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  24.69 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  23.64 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1456  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  22.19 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  21.29 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  21.54 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  20.78 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  21.9 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1287  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000310497  hitchhiker  0.00149361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  24.58 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688242  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  22.26 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  20.39 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  20.78 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  20.86 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  20.78 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  23.17 
 
 		 528 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0505  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00132801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  20.97 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  25.94 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  22.3 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  24.75 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  26 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  24.59 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  24.06 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  23.18 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4323  serine/threonine protein kinase  25.32 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  24.83 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  23.22 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  23.43 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  23.83 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4384  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.713425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4227  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000275192  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4206  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0481233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4277  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  25.31 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>