42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2425 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 379 aa  733    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  53.37 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  43.82 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  45.74 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  41.02 
 
 		 338 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  44.51 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  42.94 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  42.94 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  42.94 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  40.54 
 
 		 333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  40.56 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  42.03 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  40.34 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  38.53 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  41.52 
 
 		 318 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  28.11 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  31.64 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  34.38 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  30.59 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  32.86 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  32.05 
 
 		 333 aa  97.1  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  19.7 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  20.48 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  20.45 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  20.37 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  20.14 
 
 		 315 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  20.14 
 
 		 315 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  24.64 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  20.71 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  20 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  23.92 
 
 		 528 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  19.06 
 
 		 315 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  21.79 
 
 		 317 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  24.69 
 
 		 970 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  19.19 
 
 		 315 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  24.64 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>