38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1068 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
333 aa  649    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  34.47 
 
 
333 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 
352 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  31.75 
 
 
338 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  35.46 
 
 
336 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  34.98 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 
348 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  32.57 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  31.55 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  31.55 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  31.55 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  32.48 
 
 
379 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  30.12 
 
 
331 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
318 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
311 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 
330 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 
339 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 
347 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  31.85 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  28.87 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  31.67 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  22.06 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
374 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  22.06 
 
 
323 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  21.04 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  21.98 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  21.99 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  23.43 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  21.28 
 
 
323 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  22.18 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  18.39 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  21.63 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  21.63 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>