76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2225 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  84.1 
 
 		 373 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 374 aa  766    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  49.26 
 
 		 349 aa  315  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  43.58 
 
 		 360 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  46.44 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  40.8 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  39.47 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  40.13 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  41.74 
 
 		 345 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  38.66 
 
 		 1016 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  37.72 
 
 		 1015 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  37.43 
 
 		 1015 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  37.43 
 
 		 1015 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  38.28 
 
 		 1018 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1023 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1049 aa  194  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  34.02 
 
 		 978 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 994 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1003 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  30.89 
 
 		 976 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  30.82 
 
 		 970 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  29.28 
 
 		 970 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  30.31 
 
 		 976 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  29.91 
 
 		 973 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  29.87 
 
 		 973 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  31.13 
 
 		 970 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  31.23 
 
 		 974 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  31.63 
 
 		 975 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  30.89 
 
 		 966 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  34.29 
 
 		 977 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  30.36 
 
 		 981 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  30.36 
 
 		 981 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  29.7 
 
 		 981 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  29.75 
 
 		 967 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  28.52 
 
 		 910 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  31.4 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  29.56 
 
 		 524 aa  66.2  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  28.7 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  29.63 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  28.57 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  25.28 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  29.06 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  26.74 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  26.87 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  28.25 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  26.44 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  30.3 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  27.44 
 
 		 326 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  20.1 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  27.78 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  27.12 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  25.81 
 
 		 321 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  24.34 
 
 		 330 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  27.24 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  24.34 
 
 		 330 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  24.34 
 
 		 330 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  25.81 
 
 		 327 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  27.48 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  32.37 
 
 		 311 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28844  predicted protein  33.64 
 
 		 249 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  25.88 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  35.23 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  26.52 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  27.59 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  27.5 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0136  homoserine kinase  25.78 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  26.95 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  29.76 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  28.02 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  27.55 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2805  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.34105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>