54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3252 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
318 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  43.71 
 
 
330 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  43.71 
 
 
330 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  43.71 
 
 
330 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  43.91 
 
 
352 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  43.23 
 
 
322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  44.19 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  41 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  41.22 
 
 
335 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  39.06 
 
 
333 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  39.73 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  38.17 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  40.78 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 
338 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  42.12 
 
 
379 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  38.64 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  34.98 
 
 
347 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  32.2 
 
 
339 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  34.73 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
356 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  34.78 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  33.94 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  25.27 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  22.09 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  23.76 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  22.07 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  22.6 
 
 
323 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  22.09 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  22.09 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  22.02 
 
 
323 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  24.5 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  24.5 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  23.5 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  23.76 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  24.24 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  24.24 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  21.57 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  23.64 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  22.17 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  22.03 
 
 
313 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  23.17 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  21.16 
 
 
313 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  23.83 
 
 
528 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  27.81 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  21.66 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  21.3 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  23.15 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  25 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28844  predicted protein  29.57 
 
 
249 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>