88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1793 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 336 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  51.39 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  51.7 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  49.69 
 
 		 335 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  44.84 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  45.85 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  41.74 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  42.49 
 
 		 330 aa  235  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  42.17 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  42.47 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  39.38 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  38.53 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  39.73 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  30.26 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  33.81 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  34.92 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  35.46 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  32.72 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  34.57 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  25.26 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  24.92 
 
 		 528 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  23.83 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  24.55 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  23.72 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  20.83 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  24.64 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  23.7 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  23.7 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  23.7 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  23.7 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  23.17 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  25.61 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  23.7 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  22.76 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  22.76 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  21.98 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  21.3 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  21.76 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  21.76 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  21.3 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  21.14 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  25.14 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  21.3 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  20.83 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  26.65 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  28.37 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  26.01 
 
 		 966 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  25.35 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  24.49 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 		 341 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3619  serine/threonine protein kinase  19.93 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  24.66 
 
 		 976 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  18.73 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  21.27 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  24.16 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  27.48 
 
 		 374 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  25.89 
 
 		 973 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  23.74 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0830  aminoglycoside phosphotransferase  27.37 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  23.84 
 
 		 974 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  24.1 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  20.96 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  25.26 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02490  conserved hypothetical protein  25.13 
 
 		 428 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3696  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.473602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  27.31 
 
 		 970 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  25.54 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  24.91 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  23.11 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  26.62 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>