45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3424 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 375 aa  733    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  54.15 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  45.73 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  44.14 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  43.1 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  44.02 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  42.3 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  37.1 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  43.02 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  43.02 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  43.02 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  36.63 
 
 		 333 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  39.06 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 		 348 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  32.15 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  32.37 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  32.05 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  31.47 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  23.73 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  22.53 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  23.65 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  22.6 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  21.25 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  23.05 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  21.05 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  20.48 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  19.86 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  19.86 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  23.38 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  19.87 
 
 		 315 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  24.05 
 
 		 528 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  25.61 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  25.18 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  28 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  26.21 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  28.65 
 
 		 967 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>