58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2246 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 348 aa  727    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  36.19 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  35.81 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  37.34 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 		 322 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  31.68 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  33.02 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  36.99 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  27.62 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  30.32 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  26.44 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  28.11 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  25.77 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  23.86 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  22.04 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  22.14 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  22.66 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  22.04 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  21.27 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  21.27 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  20.76 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  20.76 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  21.27 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  20.76 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  20.76 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  25.22 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  29.9 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  20.76 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  23.97 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  20.63 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  19.94 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  21.09 
 
 		 313 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  21.6 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  38.24 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  40.45 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  21.09 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  40.45 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  40.91 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  26.57 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  29.35 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  33.33 
 
 		 326 aa  42.7  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  29.55 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  23.87 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>