75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3215 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
355 aa  694    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
374 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  41.08 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  40.19 
 
 
371 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 
362 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
345 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  32.23 
 
 
349 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  34.66 
 
 
1018 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  33.23 
 
 
1016 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  34.26 
 
 
1003 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  35.84 
 
 
978 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  31.1 
 
 
1015 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  31.1 
 
 
1015 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  31.82 
 
 
1015 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  32.46 
 
 
1049 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  32.46 
 
 
1023 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  36.21 
 
 
994 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  33.01 
 
 
973 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  31.74 
 
 
966 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  32.2 
 
 
974 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  31.02 
 
 
973 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  29.12 
 
 
970 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  30.3 
 
 
981 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  29.67 
 
 
970 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  29.7 
 
 
981 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  29.7 
 
 
981 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  28.4 
 
 
975 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  30.12 
 
 
977 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  28.74 
 
 
976 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  29.31 
 
 
976 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  29.08 
 
 
970 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  33.02 
 
 
910 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  28.46 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  26.63 
 
 
967 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  30.48 
 
 
320 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  26.29 
 
 
524 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  26 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  28.12 
 
 
308 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  30.23 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  28.21 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  29.08 
 
 
321 aa  49.7  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 
333 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  29.21 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  33.92 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  26.67 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  30.57 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  35.48 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  28.57 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1713  homoserine kinase  25.95 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448075  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  37.5 
 
 
326 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  29.89 
 
 
327 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  29.08 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28844  predicted protein  31.11 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0505  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00132801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2990  aminoglycoside phosphotransferase  34.27 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  27.38 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2361  phosphotransferase enzyme family protein, putative  39.71 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  38.89 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2485  Hygromycin-B kinase  43.1 
 
 
293 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318408  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  38.89 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  28.02 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7830  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3696  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.473602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  33.03 
 
 
319 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  25 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  26.52 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 
338 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  30.07 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  26.98 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>