67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0311 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  98.84 
 
 		 345 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  100 
 
 		 371 aa  727    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  81.17 
 
 		 345 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  44.58 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  39.47 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  44.37 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  40.47 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  41.23 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  42.06 
 
 		 360 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1015 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1015 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  41.37 
 
 		 1015 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  41.88 
 
 		 1016 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  41.09 
 
 		 1018 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1023 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  39.14 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  37.79 
 
 		 1049 aa  199  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  40.71 
 
 		 978 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  37.62 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  35.16 
 
 		 973 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  34.38 
 
 		 970 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1003 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  34.21 
 
 		 970 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  34.1 
 
 		 973 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  34.1 
 
 		 970 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  35 
 
 		 994 aa  136  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  34.12 
 
 		 976 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  36.48 
 
 		 975 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  32.93 
 
 		 976 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  34.85 
 
 		 966 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  34.73 
 
 		 974 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  34.1 
 
 		 981 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  34.1 
 
 		 981 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  34.1 
 
 		 981 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  31.61 
 
 		 977 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  32.76 
 
 		 910 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  31.29 
 
 		 967 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  24.8 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  27.6 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  31.73 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  31.87 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  31.73 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  29.88 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  31.87 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  26.96 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  21.94 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0084  Homoserine kinase  32.14 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  28.98 
 
 		 326 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  26.69 
 
 		 326 aa  49.7  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28844  predicted protein  29.91 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2807  hypothetical protein  22.75 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  28.74 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2483  phosphotransferase enzyme family, putative  22.32 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.882725  normal  0.741091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  30.16 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  19.31 
 
 		 306 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  28.41 
 
 		 316 aa  46.6  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  34.34 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  28.12 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  27.13 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  27.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  25.82 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  25.66 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  26.8 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  28.74 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  26.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  30.62 
 
 		 339 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  26.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>