45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0415 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 360 aa  715    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  78.38 
 
 		 351 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  44.61 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  43.58 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  45.91 
 
 		 349 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  44.95 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1016 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  42.11 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  39.82 
 
 		 1018 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  37.9 
 
 		 1015 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  37.9 
 
 		 1015 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1023 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  36.66 
 
 		 1015 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  41.04 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1049 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  36.42 
 
 		 978 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  36.98 
 
 		 1003 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  36.75 
 
 		 994 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  34.1 
 
 		 975 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  33 
 
 		 974 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  34.58 
 
 		 973 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  31.51 
 
 		 981 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  31.51 
 
 		 981 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  33.54 
 
 		 970 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  31.51 
 
 		 981 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  34.09 
 
 		 973 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  34.07 
 
 		 976 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  33.99 
 
 		 976 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  32.32 
 
 		 970 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  34.78 
 
 		 966 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  32.79 
 
 		 970 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  30.36 
 
 		 977 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  28.85 
 
 		 967 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  33.46 
 
 		 910 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  27.23 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  24.74 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  32.52 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  25.61 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  24.13 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  25.44 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  25.6 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  26.54 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>