45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1273 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
349 aa  713    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  49.26 
 
 
374 aa  315  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  47.65 
 
 
373 aa  306  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  45.91 
 
 
360 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  44.69 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  40.36 
 
 
362 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  41.25 
 
 
371 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 
345 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 
345 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  36.68 
 
 
1015 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  36.99 
 
 
1015 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  36.68 
 
 
1015 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  37.19 
 
 
1016 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  37.19 
 
 
1018 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  36.7 
 
 
1023 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  35.71 
 
 
1049 aa  189  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  32.23 
 
 
355 aa  176  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  33.04 
 
 
978 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 
364 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  28.86 
 
 
974 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  37.28 
 
 
994 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  29.39 
 
 
973 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  30.03 
 
 
973 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  30.13 
 
 
975 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  30.5 
 
 
1003 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  29.01 
 
 
970 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  28.7 
 
 
970 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  28.05 
 
 
981 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  29.66 
 
 
970 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  28.28 
 
 
976 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  27.74 
 
 
981 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  27.74 
 
 
981 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  28.14 
 
 
966 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  29.34 
 
 
977 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  26.39 
 
 
976 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  28.31 
 
 
910 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  25.68 
 
 
967 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  34.92 
 
 
524 aa  77  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  22.54 
 
 
514 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  29.31 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  22.81 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  26.17 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  21.69 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  26.76 
 
 
316 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  26.16 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>