71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2539 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 373 aa  764    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  84.1 
 
 		 374 aa  638    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  47.65 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  44.61 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  45.85 
 
 		 351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  40.8 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  41.19 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  41.56 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  39.81 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  38.76 
 
 		 1015 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1015 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  38.17 
 
 		 1015 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  38.05 
 
 		 1016 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1023 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  35.55 
 
 		 1049 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  37.87 
 
 		 1018 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  35.1 
 
 		 978 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  31.97 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  33.02 
 
 		 994 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  31.33 
 
 		 976 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1003 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  30.06 
 
 		 970 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  31.82 
 
 		 966 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  29.43 
 
 		 970 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  28.74 
 
 		 976 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  30.22 
 
 		 973 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  29.69 
 
 		 973 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  29.38 
 
 		 970 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  29.07 
 
 		 974 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  30.42 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  29.56 
 
 		 910 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  29.31 
 
 		 981 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  29.31 
 
 		 981 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  29.31 
 
 		 981 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  31.09 
 
 		 967 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  30.16 
 
 		 977 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  30.19 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  29.57 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  28.14 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  20.51 
 
 		 514 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28844  predicted protein  35.51 
 
 		 249 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  29.47 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  21.4 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2627  homoserine kinase  25.66 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  26.19 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  28.68 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  27.33 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  36.54 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  26.67 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  26.52 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  26.07 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  28.52 
 
 		 324 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  21.6 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  26.37 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  28.81 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 		 429 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2805  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.34105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  28.11 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  25.19 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  30.08 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  26.24 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  26.99 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  50 
 
 		 668 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0433  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>