78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2109 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  20.97 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  25.44 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  21.32 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  23.97 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  23.97 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  23.45 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  21.43 
 
 
352 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  25.8 
 
 
350 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  19.93 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  20.93 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  29.3 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  24.73 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  20.54 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  20.54 
 
 
322 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  23.63 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  22.79 
 
 
329 aa  55.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  21.65 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  20.26 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2830  aminoglycoside phosphotransferase  26 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  23.46 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  25.1 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  23.29 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2858  hypothetical protein  25.5 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.302203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  23.05 
 
 
320 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2483  phosphotransferase enzyme family, putative  24.38 
 
 
309 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.882725  normal  0.741091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  23.47 
 
 
334 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  29.41 
 
 
313 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2790  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  20.42 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3072  hypothetical protein  25.5 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  24.91 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  21.4 
 
 
373 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3081  hypothetical protein  24.62 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  23.46 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3097  hypothetical protein  26.26 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  23.29 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2807  hypothetical protein  23.83 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  24.2 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  24.2 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  21.37 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  22.27 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3066  hypothetical protein  24.75 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  19.23 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  20 
 
 
331 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  24.28 
 
 
317 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2852  aminoglycoside phosphotransferase  25.13 
 
 
312 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00333465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2828  hypothetical protein  19.58 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  24.61 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2603  aminoglycoside phosphotransferase  22.58 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.337821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2325  aminoglycoside phosphotransferase, N-terminal region  26.28 
 
 
147 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0712052  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1448  spectinomycin phosphotransferase  22.48 
 
 
332 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  20.08 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  21.51 
 
 
528 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  23.36 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  19.67 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  22.73 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2181  aminoglycoside phosphotransferase  23.59 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  21.79 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  20.96 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  23.97 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  22.16 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  23.14 
 
 
326 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2067  homoserine kinase  25.13 
 
 
391 aa  43.5  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  25.22 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3705  protein kinase  24.78 
 
 
449 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424517  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  20 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  21.6 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  21.6 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  21.6 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3100  hypothetical protein  22 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  30.47 
 
 
323 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  22.01 
 
 
328 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1535  spectinomycin phosphotransferase  23.23 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0505  aminoglycoside phosphotransferase  21.86 
 
 
325 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00132801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  23.14 
 
 
326 aa  42.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  28.91 
 
 
323 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>