227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1248 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 354 aa  720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  51.72 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  55.46 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  50.87 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  51.21 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  50.99 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  51.44 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  48.67 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  45.82 
 
 		 380 aa  345  8.999999999999999e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  47.26 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  46.97 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  48.95 
 
 		 356 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  48.95 
 
 		 356 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  48.64 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  48.34 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  47.13 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  45.27 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  51.44 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  51.44 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  51.44 
 
 		 876 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  51.15 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  51.15 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  51.15 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  51.15 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  51.15 
 
 		 358 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  45.92 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  48.96 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  44.03 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  41.31 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  42.49 
 
 		 348 aa  272  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  44.14 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  41.39 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  42.73 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  36.55 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  37.43 
 
 		 352 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.63 
 
 		 815 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  36.56 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.14 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 		 354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.07 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.01 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  37.17 
 
 		 339 aa  195  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  34.4 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  36.09 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 		 353 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  36.25 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  35.33 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.73 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  35.33 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  31.49 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  35.93 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  35.26 
 
 		 391 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  35.93 
 
 		 368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  35.93 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  35.93 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  35.93 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  35.93 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  35.93 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  34.6 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.1 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 352 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  32.85 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 		 336 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 		 344 aa  172  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  36.13 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  31.93 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 		 343 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  31.98 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 		 355 aa  169  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  33.93 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  31.93 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  32.23 
 
 		 368 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  33.93 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  31.72 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  31.66 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  35.35 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>