More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2580 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  55.84 
 
 		 976 aa  1034    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  56.66 
 
 		 910 aa  984    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  57.01 
 
 		 970 aa  1076    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  61.64 
 
 		 974 aa  1181    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  64.55 
 
 		 973 aa  1238    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  48.1 
 
 		 981 aa  817    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  56.8 
 
 		 970 aa  1075    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  58.29 
 
 		 970 aa  1099    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  63.9 
 
 		 973 aa  1236    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  55.89 
 
 		 966 aa  1020    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  47.56 
 
 		 967 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  56.44 
 
 		 976 aa  1039    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  100 
 
 		 975 aa  1962    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  47.86 
 
 		 981 aa  817    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  47.86 
 
 		 981 aa  817    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  46.49 
 
 		 977 aa  790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  35.27 
 
 		 994 aa  462  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1018 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  31.77 
 
 		 1003 aa  429  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  35.4 
 
 		 978 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1023 aa  422  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1049 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  33.24 
 
 		 1016 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1015 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1015 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1015 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  38.24 
 
 		 434 aa  297  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  39.91 
 
 		 427 aa  296  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  38.23 
 
 		 427 aa  294  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  38 
 
 		 434 aa  292  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  38.39 
 
 		 427 aa  285  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  39.34 
 
 		 416 aa  284  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  41.38 
 
 		 427 aa  282  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  40.32 
 
 		 448 aa  278  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  35.63 
 
 		 424 aa  269  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  35.43 
 
 		 427 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  34.8 
 
 		 447 aa  266  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  39.49 
 
 		 443 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  36.89 
 
 		 442 aa  261  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  35.06 
 
 		 447 aa  261  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  34.82 
 
 		 446 aa  260  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  34.44 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  34.49 
 
 		 448 aa  259  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  34.03 
 
 		 448 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  38.85 
 
 		 413 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  36.34 
 
 		 429 aa  254  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  36.1 
 
 		 433 aa  254  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  36.47 
 
 		 436 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  35.31 
 
 		 465 aa  237  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  38.12 
 
 		 436 aa  225  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  37.65 
 
 		 436 aa  225  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  36.67 
 
 		 436 aa  225  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  34.1 
 
 		 437 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.93 
 
 		 436 aa  212  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  35.66 
 
 		 451 aa  209  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  34.12 
 
 		 433 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  35.03 
 
 		 432 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  34.12 
 
 		 433 aa  207  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  33.18 
 
 		 433 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  33.18 
 
 		 433 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  34.25 
 
 		 433 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  32.64 
 
 		 433 aa  200  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.26 
 
 		 461 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  33.03 
 
 		 433 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  35.45 
 
 		 434 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  34.86 
 
 		 431 aa  196  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  35.48 
 
 		 430 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  33.41 
 
 		 433 aa  193  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.53 
 
 		 428 aa  193  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  34.95 
 
 		 446 aa  188  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 431 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  32.07 
 
 		 436 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  33.58 
 
 		 446 aa  185  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  30.81 
 
 		 433 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  30.12 
 
 		 436 aa  184  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  32.06 
 
 		 431 aa  184  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  31.35 
 
 		 431 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  31.59 
 
 		 452 aa  181  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.51 
 
 		 479 aa  181  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  29.89 
 
 		 452 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  30.87 
 
 		 465 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  33.79 
 
 		 459 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  32.92 
 
 		 436 aa  179  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  31.23 
 
 		 427 aa  179  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  34.28 
 
 		 468 aa  179  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  31.31 
 
 		 433 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  33.17 
 
 		 436 aa  178  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  32.94 
 
 		 437 aa  177  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  34 
 
 		 443 aa  177  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  32.14 
 
 		 433 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  32.66 
 
 		 429 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 		 427 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  30.41 
 
 		 440 aa  174  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  32.74 
 
 		 465 aa  173  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.58 
 
 		 391 aa  173  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  30.86 
 
 		 395 aa  173  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  31.57 
 
 		 426 aa  172  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.5 
 
 		 448 aa  172  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  32.99 
 
 		 425 aa  172  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  33.33 
 
 		 418 aa  172  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>