48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5226 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 351 aa  692    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  77.52 
 
 		 360 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  45.85 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  44.69 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  46.44 
 
 		 374 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  45.26 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  44.41 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  44.41 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 345 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  40 
 
 		 1016 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  38.9 
 
 		 1023 aa  205  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1015 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1015 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1015 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1049 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1018 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  37.72 
 
 		 978 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  37.82 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1003 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  38.86 
 
 		 994 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  33.53 
 
 		 981 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  33.53 
 
 		 981 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  33.53 
 
 		 981 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  33.67 
 
 		 974 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  31.76 
 
 		 970 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  32.62 
 
 		 970 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  32.26 
 
 		 976 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  34.24 
 
 		 975 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  31.96 
 
 		 976 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  32.2 
 
 		 973 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  32.77 
 
 		 973 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  31.72 
 
 		 970 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  33.99 
 
 		 966 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  32.01 
 
 		 977 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  29.84 
 
 		 967 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  31.76 
 
 		 910 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  24.83 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  31.51 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  26.53 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  26.64 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  23.51 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  37.31 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  31.8 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  29.64 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7830  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  26.61 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>