237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2337 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
353 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  55.46 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  54.89 
 
 
351 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  54.68 
 
 
357 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 
348 aa  341  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  49.44 
 
 
348 aa  332  7.000000000000001e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  49.02 
 
 
361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  49.02 
 
 
362 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  46.69 
 
 
344 aa  318  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  43.43 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  43.97 
 
 
355 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  44.51 
 
 
355 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  44.79 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  41.97 
 
 
355 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  44.18 
 
 
355 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  43.97 
 
 
355 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  43.38 
 
 
355 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  44.83 
 
 
354 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  47.38 
 
 
350 aa  295  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  43.84 
 
 
356 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  43.1 
 
 
355 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  43.84 
 
 
356 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  46.24 
 
 
357 aa  279  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  44.93 
 
 
358 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  41.53 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  40.79 
 
 
355 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  44.98 
 
 
379 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  43.45 
 
 
429 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  44.14 
 
 
354 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.4 
 
 
380 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
403 aa  253  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  39.16 
 
 
370 aa  252  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.01 
 
 
815 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  40.79 
 
 
358 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  40.79 
 
 
358 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  40.79 
 
 
358 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  40.79 
 
 
358 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  40.79 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  40.79 
 
 
358 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  40.79 
 
 
876 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  41.76 
 
 
341 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  40.63 
 
 
358 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  40.42 
 
 
377 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  42.02 
 
 
359 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 
338 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 
344 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  40.29 
 
 
356 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  42.38 
 
 
344 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  38.87 
 
 
349 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  40.73 
 
 
362 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  41.19 
 
 
338 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.57 
 
 
339 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  39.72 
 
 
354 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  41.2 
 
 
353 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  38.72 
 
 
349 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  39.08 
 
 
315 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  39.76 
 
 
347 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  41.67 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  37.2 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  41.95 
 
 
350 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  35.21 
 
 
358 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  35.21 
 
 
348 aa  192  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  38.74 
 
 
338 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  38.74 
 
 
338 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  38.74 
 
 
338 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 
352 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
356 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  39.33 
 
 
451 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  32.96 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  35.94 
 
 
353 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  33.9 
 
 
388 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  33.71 
 
 
352 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  39.16 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  37.08 
 
 
355 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 
355 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  35.81 
 
 
351 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
358 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  32.11 
 
 
353 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  32.2 
 
 
364 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 
348 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  36.55 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  37.11 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
359 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
353 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
353 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  32.67 
 
 
352 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  31.07 
 
 
354 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  36.22 
 
 
352 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  35.2 
 
 
353 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  31.88 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 
339 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
353 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  30.08 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 
358 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  30.79 
 
 
358 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>