58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5904 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
364 aa  737    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  37.82 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  37.62 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 
349 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 
345 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 
345 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
362 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 
360 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  31.97 
 
 
373 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  32.3 
 
 
1018 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  32.2 
 
 
994 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  32.42 
 
 
978 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  29.43 
 
 
1015 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  29.13 
 
 
1015 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  29.84 
 
 
1016 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  28.53 
 
 
1015 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  32.02 
 
 
975 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  29.92 
 
 
1023 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  30.72 
 
 
974 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  29.25 
 
 
1003 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  29.53 
 
 
1049 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  34.32 
 
 
973 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  32.16 
 
 
973 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  33.2 
 
 
976 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  33.9 
 
 
966 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  28.18 
 
 
970 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  30.83 
 
 
967 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  30.13 
 
 
970 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  30 
 
 
976 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  32.79 
 
 
981 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  32.79 
 
 
981 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  32.79 
 
 
981 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  30.34 
 
 
970 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  32.27 
 
 
977 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  33.73 
 
 
910 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  25.08 
 
 
514 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 
338 aa  56.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  26.64 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  30 
 
 
319 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  28.73 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  22.97 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  27.51 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  28.25 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  27.15 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  27.41 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  27.16 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  26.24 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  27.88 
 
 
326 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  29.7 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  23.74 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  25 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  25.88 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  27.99 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2807  hypothetical protein  22.47 
 
 
309 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  25.94 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  27.47 
 
 
320 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>