50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5425 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
362 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  44.95 
 
 
360 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  40.8 
 
 
374 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  40.8 
 
 
373 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  45.26 
 
 
351 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  40.36 
 
 
349 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  43.17 
 
 
371 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  41.43 
 
 
345 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  43.17 
 
 
345 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  39.63 
 
 
355 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  36.31 
 
 
1023 aa  199  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  36.47 
 
 
1016 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  36.28 
 
 
1015 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  35.37 
 
 
1015 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  35.37 
 
 
1015 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  35.71 
 
 
1049 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  38.96 
 
 
1018 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
364 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  33.97 
 
 
978 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  30.79 
 
 
1003 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  31.48 
 
 
994 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  29.77 
 
 
970 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  30.09 
 
 
970 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  29.18 
 
 
976 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  29.88 
 
 
975 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  29.38 
 
 
970 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  26.92 
 
 
976 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  27.41 
 
 
981 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  27.11 
 
 
981 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  27.11 
 
 
981 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  29.19 
 
 
966 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  26.52 
 
 
973 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  29.41 
 
 
967 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  28.62 
 
 
974 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  26.95 
 
 
973 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  26.89 
 
 
977 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  26.74 
 
 
910 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  30 
 
 
524 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  22.43 
 
 
514 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  25.43 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  28.04 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  25.19 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  23.72 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  29.03 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  27.83 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  22.79 
 
 
335 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  25.57 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  24.75 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  25.66 
 
 
326 aa  43.1  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>