84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2485 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2485  Hygromycin-B kinase  100 
 
 
293 aa  593  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2613  Hygromycin-B kinase  36.6 
 
 
306 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1024  aminoglycoside phosphotransferase  26.52 
 
 
307 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 
341 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  27.75 
 
 
353 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  28.17 
 
 
353 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 
361 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 
368 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 
362 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  30.64 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 
353 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  31.65 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  47.06 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
368 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 
348 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  44.26 
 
 
408 aa  48.9  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  30.64 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  24.89 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  45.9 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
344 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  24.57 
 
 
355 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
355 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  26.7 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 
347 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 
339 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 
361 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  35.64 
 
 
362 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  32.88 
 
 
359 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  31.62 
 
 
350 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  31.62 
 
 
350 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  29.48 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.68 
 
 
358 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  29.1 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  43.1 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  43.33 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  32.86 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2720  fructosamine kinase-like protein  20.88 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.093982  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2485  aminoglycoside phosphotransferase  54 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2466  aminoglycoside phosphotransferase  41.27 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  36.11 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  46.77 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  30.64 
 
 
358 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  29.56 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  46.77 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2803  hypothetical protein  38.89 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121298  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  29.14 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  38.96 
 
 
343 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  30.88 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  29.52 
 
 
360 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  43.28 
 
 
354 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 
354 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.59 
 
 
358 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  28.64 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
354 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  43.14 
 
 
329 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 
343 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 
357 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  35.21 
 
 
354 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  42.65 
 
 
349 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  45.1 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 
355 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  42.62 
 
 
352 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  23.35 
 
 
340 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  30.85 
 
 
357 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 
354 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  27.75 
 
 
367 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0433  aminoglycoside phosphotransferase  38.64 
 
 
338 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  27.75 
 
 
366 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  27.75 
 
 
366 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
355 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>