30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3696 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3696  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
327 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.473602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2990  aminoglycoside phosphotransferase  38.39 
 
 
329 aa  188  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20240  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  38.23 
 
 
320 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0939917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0938  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0505  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00132801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  27.17 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3665  aminoglycoside phosphotransferase  32.43 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  31.18 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  31.18 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.28 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  29.23 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4947  aminoglycoside phosphotransferase  33.66 
 
 
268 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4482  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 
268 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  33.72 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  31.18 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  0.0000791829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  26.43 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  26.43 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  26.43 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  26.36 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  33.73 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  26.04 
 
 
344 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  38.36 
 
 
459 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>