243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1813 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 344 aa  719    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  64.39 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  62.91 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  62.87 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  60.24 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  59.88 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  60.18 
 
 		 342 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  61.01 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  61.01 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  61.01 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  59.64 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  59.82 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  59.23 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  56.85 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  52.94 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  52.94 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  51.34 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  51.34 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  52.25 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  52.65 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  50.75 
 
 		 358 aa  361  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  50.57 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  50.44 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  54.01 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  50.15 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  49.86 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  52.07 
 
 		 348 aa  352  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  52.78 
 
 		 363 aa  352  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  50.29 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 		 368 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 368 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  51.33 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  50.88 
 
 		 368 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  48.96 
 
 		 358 aa  349  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  50.57 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  50.58 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 		 388 aa  348  9e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  50.74 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  49.11 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  50.15 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  51.94 
 
 		 336 aa  342  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 		 353 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  50.31 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  48.04 
 
 		 352 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  48.07 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  48.63 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  47.72 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  47.98 
 
 		 363 aa  329  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  46.83 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  46.83 
 
 		 353 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  45.56 
 
 		 353 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  46.43 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  43.88 
 
 		 353 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  48.68 
 
 		 352 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  43.58 
 
 		 353 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  47.25 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  46.77 
 
 		 339 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  46.6 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  43.81 
 
 		 358 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  42.69 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  44.33 
 
 		 337 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  38.17 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  43.02 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.28 
 
 		 338 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  37.39 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  35.38 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  33.99 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  35.04 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.47 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  36.18 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.71 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  34.3 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 		 347 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  34.38 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  34.38 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  32.25 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  35.46 
 
 		 348 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.14 
 
 		 355 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  32.25 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>