201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0894 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
459 aa  905    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 
450 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  38.1 
 
 
334 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  38.04 
 
 
331 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  42.06 
 
 
337 aa  87  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  37.95 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  42.06 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  36.48 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  41.9 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  37.86 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  40.2 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  31.94 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  31.94 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  31.94 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  34.92 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  42.68 
 
 
332 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  36.51 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  38.3 
 
 
342 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  37.98 
 
 
343 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 
343 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 
343 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 
340 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  31.97 
 
 
355 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
344 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  33.61 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  29.95 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 
343 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
353 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  31.32 
 
 
358 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  36.21 
 
 
343 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  32.16 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 
355 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  31.52 
 
 
325 aa  60.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  30.83 
 
 
355 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 
363 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  36.15 
 
 
343 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  34.13 
 
 
368 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  30.33 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  36.44 
 
 
357 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.13 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 
343 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  32.82 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 
361 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4604  aminoglycoside phosphotransferase  26.84 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 
339 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  36 
 
 
344 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  31.3 
 
 
363 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  48.65 
 
 
354 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  32.59 
 
 
352 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  31.55 
 
 
358 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  33.87 
 
 
368 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  30.69 
 
 
363 aa  56.6  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 
303 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  26.01 
 
 
323 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  29.27 
 
 
337 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  46.88 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  31.97 
 
 
356 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
380 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.8 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  30.85 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  37.9 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  38.17 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  25.76 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 
355 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  31.97 
 
 
356 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
346 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  37.84 
 
 
344 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  29.27 
 
 
355 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  29.92 
 
 
346 aa  53.9  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  31.2 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  36.11 
 
 
349 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 
350 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  30.83 
 
 
352 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  29.85 
 
 
368 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  34.31 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  31.15 
 
 
355 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  34.92 
 
 
348 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4497  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
382 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609901  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 
354 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 
352 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 
354 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  31.01 
 
 
359 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 
354 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  31.3 
 
 
353 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>