105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1892 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 344 aa  702    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  82.85 
 
 		 344 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  46.65 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  25.88 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  25.95 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  26.06 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  26.56 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  25.4 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  26.21 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0939  putative homoserine kinase type II  24.65 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000121623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  26.06 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  23.65 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  24.92 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  25.8 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  23.73 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  24.47 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  25.89 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  24.6 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2990  aminoglycoside phosphotransferase  29.68 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  25.08 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  25.63 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  24.75 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  27 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  23.1 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  25.48 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  24.84 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  24.84 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  24.37 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  25.25 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  25.32 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  23.13 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  25.57 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  25.32 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  27.8 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  23.7 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  25.21 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  27.8 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  25.68 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  26.97 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  27.62 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  23.77 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  24.35 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  27.27 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  26.83 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  24.42 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  25.34 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  24.09 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  24.5 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  24.5 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1580  Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  24.7 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  hitchhiker  9.565629999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  24.38 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  22.27 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2674  hypothetical protein  22.17 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0325383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2867  hypothetical protein  22.17 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.102761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  23.76 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2622  homoserine kinase  25.83 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  25.68 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  25.68 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2483  phosphotransferase enzyme family, putative  20.4 
 
 		 309 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.882725  normal  0.741091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0433  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  23.1 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02691  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2828  hypothetical protein  21.43 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0505  aminoglycoside phosphotransferase  24.9 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00132801  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3846  aminoglycoside phosphotransferase  23.91 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.646827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2807  hypothetical protein  20.4 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  21.81 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4687  aminoglycoside phosphotransferase  23.91 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3676  aminoglycoside phosphotransferase  23.91 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  25.68 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2485  aminoglycoside phosphotransferase  41.79 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  25.86 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  24.33 
 
 		 321 aa  49.7  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0151  aminoglycoside phosphotransferase  25.62 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7830  aminoglycoside phosphotransferase  24.33 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3696  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.473602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2434  aminoglycoside phosphotransferase  23.29 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6316  aminoglycoside phosphotransferase  28.45 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1763  aminoglycoside phosphotransferase  28.45 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  21.55 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0158  hypothetical protein  22.33 
 
 		 234 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0129  aminoglycoside phosphotransferase  26.96 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  22.11 
 
 		 316 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  26.45 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  26.43 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  20.93 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  25.78 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1776  aminoglycoside phosphotransferase  29.31 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1526  hypothetical protein  34.02 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  22.54 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  22.41 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2606  hypothetical protein  24.24 
 
 		 242 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0807652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  41.18 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  24.39 
 
 		 976 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  25.13 
 
 		 966 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  26.52 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  18.97 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0327  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2603  aminoglycoside phosphotransferase  21.46 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.337821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  25.9 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>