122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4229 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  96.34 
 
 		 328 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 328 aa  676    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  74.09 
 
 		 328 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000857443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  74.09 
 
 		 328 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  74.09 
 
 		 328 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  73.78 
 
 		 328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000036631  hitchhiker  0.000000828535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4166  aminoglycoside phosphotransferase  72.56 
 
 		 328 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0215875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3969  aminoglycoside phosphotransferase  70.43 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00010799  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  68.6 
 
 		 328 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  68.6 
 
 		 328 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  68.6 
 
 		 328 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  68.6 
 
 		 328 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  68.9 
 
 		 328 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  0.0000791829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  68.9 
 
 		 328 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  68.9 
 
 		 328 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  68.6 
 
 		 328 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4331  serine/threonine protein kinase  68.29 
 
 		 328 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  65.55 
 
 		 328 aa  461  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4277  serine/threonine protein kinase  66.16 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4323  serine/threonine protein kinase  66.16 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4206  serine/threonine protein kinase  66.16 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0481233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4227  serine/threonine protein kinase  66.16 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000275192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4384  serine/threonine protein kinase  66.16 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.713425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0045  serine/threonine protein kinase  57.93 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00403  serine/threonine protein kinase  56.1 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  56.1 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  58.23 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3574  serine/threonine protein kinase  55.62 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  54.18 
 
 		 340 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  54.18 
 
 		 340 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  54.18 
 
 		 340 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  53.56 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  54.18 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  52.62 
 
 		 325 aa  349  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  54.43 
 
 		 345 aa  348  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  52.65 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  54.13 
 
 		 330 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  51.38 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  49.39 
 
 		 333 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  52.29 
 
 		 329 aa  330  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  51.37 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4349  serine/threonine protein kinase  50.93 
 
 		 328 aa  324  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  48.8 
 
 		 346 aa  318  9e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  48.8 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  49.69 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  47.93 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1287  serine/threonine protein kinase  49.69 
 
 		 330 aa  308  9e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000310497  hitchhiker  0.00149361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0621  serine/threonine protein kinase  47.08 
 
 		 357 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3582  serine/threonine protein kinase  47.31 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  48.2 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  46.65 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  47.29 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688242  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  49.22 
 
 		 328 aa  288  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  47.2 
 
 		 340 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  47.35 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  46.08 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 343 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4969  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  46.86 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0540  serine/threonine protein kinase  46.11 
 
 		 347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  47.02 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0435  serine/threonine protein kinase  45.29 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0421  serine/threonine protein kinase  46.11 
 
 		 344 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.083044  hitchhiker  0.000109607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3619  serine/threonine protein kinase  43.38 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2459  serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3073  serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  45.48 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  45.14 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3069  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3119  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 343 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3091  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 		 343 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  45.9 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  46.08 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4697  serine/threonine protein kinase  46.71 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  44.71 
 
 		 346 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  43.89 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  44.31 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>