130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0399 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 334 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  86.53 
 
 		 334 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  78.01 
 
 		 342 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  75.3 
 
 		 333 aa  531  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  73.93 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  73.93 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  73.25 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  73.93 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  73.93 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  70.99 
 
 		 333 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  72.81 
 
 		 345 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  71.39 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  71.39 
 
 		 345 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  72.7 
 
 		 330 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  69.63 
 
 		 329 aa  478  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  58.28 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3574  serine/threonine protein kinase  58.2 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  57.28 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00403  serine/threonine protein kinase  56.97 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  56.57 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4349  serine/threonine protein kinase  57.1 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0045  serine/threonine protein kinase  52.73 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  52.74 
 
 		 328 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000857443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  52.74 
 
 		 328 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  52.74 
 
 		 328 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3969  aminoglycoside phosphotransferase  53.82 
 
 		 328 aa  351  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00010799  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4166  aminoglycoside phosphotransferase  51.68 
 
 		 328 aa  348  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0215875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  51.83 
 
 		 328 aa  348  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  51.67 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  0.0000791829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  51.83 
 
 		 328 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  51.37 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  51.37 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  51.37 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  51.37 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  51.37 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4331  serine/threonine protein kinase  51.37 
 
 		 328 aa  345  7e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4323  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  51.38 
 
 		 328 aa  338  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  50.76 
 
 		 328 aa  338  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000036631  hitchhiker  0.000000828535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4227  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 		 328 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000275192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4384  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 		 328 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.713425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4277  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 		 328 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4206  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 		 328 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0481233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  51.08 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  50.31 
 
 		 328 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  47.65 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  47.5 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688242  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1287  serine/threonine protein kinase  48.61 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000310497  hitchhiker  0.00149361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  49.06 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  48.75 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3619  serine/threonine protein kinase  46.48 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  48.44 
 
 		 324 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  47.59 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  47.59 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  48.6 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  46.75 
 
 		 351 aa  315  9e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  47.81 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  47.81 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  44.68 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  48.6 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  47.5 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  48.76 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  46.23 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  46.88 
 
 		 324 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4697  serine/threonine protein kinase  46.25 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0435  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0621  serine/threonine protein kinase  45.53 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  45.26 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0540  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  46.25 
 
 		 328 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0421  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.083044  hitchhiker  0.000109607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3582  serine/threonine protein kinase  45.02 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  44.68 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  44.88 
 
 		 354 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  44.38 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  46.73 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 		 332 aa  295  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  47.04 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4969  serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 		 344 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  44.98 
 
 		 346 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  45.18 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  47.04 
 
 		 341 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  46.11 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  45.17 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  44.79 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  41.84 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  41.69 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 		 346 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  43.71 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  43.03 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  42.72 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>