126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2484 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
340 aa  704    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  76.05 
 
 
334 aa  544  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00403  serine/threonine protein kinase  75 
 
 
340 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0045  serine/threonine protein kinase  71.65 
 
 
327 aa  504  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  59.45 
 
 
328 aa  427  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000857443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  59.45 
 
 
328 aa  427  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  59.45 
 
 
328 aa  427  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3574  serine/threonine protein kinase  60.12 
 
 
321 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  59.57 
 
 
328 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000036631  hitchhiker  0.000000828535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  58.84 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  58.23 
 
 
328 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3969  aminoglycoside phosphotransferase  58.54 
 
 
328 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00010799  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4166  aminoglycoside phosphotransferase  57.93 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0215875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  60.92 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  55.79 
 
 
328 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  55.79 
 
 
328 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  56.1 
 
 
328 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  59.23 
 
 
345 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  55.79 
 
 
328 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  55.79 
 
 
328 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  56.1 
 
 
328 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  0.0000791829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  55.79 
 
 
328 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  55.79 
 
 
328 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  58.63 
 
 
340 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  59.34 
 
 
340 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  58.63 
 
 
340 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  58.33 
 
 
340 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4331  serine/threonine protein kinase  55.49 
 
 
328 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  57.58 
 
 
333 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  53.96 
 
 
328 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  59.33 
 
 
345 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  59.63 
 
 
351 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  59.63 
 
 
345 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  59.63 
 
 
330 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4384  serine/threonine protein kinase  53.66 
 
 
328 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.713425  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4227  serine/threonine protein kinase  53.66 
 
 
328 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000275192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4277  serine/threonine protein kinase  53.66 
 
 
328 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4323  serine/threonine protein kinase  53.66 
 
 
328 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4206  serine/threonine protein kinase  53.66 
 
 
328 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0481233  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4349  serine/threonine protein kinase  59.08 
 
 
328 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  57.01 
 
 
334 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  56.57 
 
 
334 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  58.59 
 
 
329 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  55.62 
 
 
342 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  52.62 
 
 
325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1287  serine/threonine protein kinase  51.56 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000310497  hitchhiker  0.00149361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 
328 aa  329  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  49.69 
 
 
340 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  49.38 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  50.77 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  51.88 
 
 
324 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688242  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  49.38 
 
 
342 aa  326  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  49.7 
 
 
328 aa  326  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  48.77 
 
 
346 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  48.52 
 
 
351 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3582  serine/threonine protein kinase  48.82 
 
 
349 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  48.77 
 
 
343 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  48.18 
 
 
343 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  48.18 
 
 
343 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  48.18 
 
 
343 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  48.18 
 
 
343 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  51.22 
 
 
328 aa  322  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  51.41 
 
 
324 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0621  serine/threonine protein kinase  48.13 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  50.61 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  50 
 
 
324 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  47.79 
 
 
346 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  48.26 
 
 
354 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  47.87 
 
 
346 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  47.79 
 
 
346 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  50.46 
 
 
324 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0435  serine/threonine protein kinase  47.08 
 
 
350 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3619  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
331 aa  315  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  47.99 
 
 
343 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2459  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3073  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  50.15 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  50.16 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3069  serine/threonine protein kinase  47.68 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  47.5 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  45.73 
 
 
359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3119  serine/threonine protein kinase  47.5 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0540  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205234  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  45 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  49.39 
 
 
328 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3091  serine/threonine protein kinase  47.06 
 
 
343 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0421  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 
344 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.083044  hitchhiker  0.000109607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  48.5 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  49.84 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  48.62 
 
 
324 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  46.06 
 
 
346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  47.66 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4697  serine/threonine protein kinase  50.62 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  48.76 
 
 
328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 
328 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  47.72 
 
 
354 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
324 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  46.08 
 
 
348 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>