118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4969 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4969  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 344 aa  700    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  71.6 
 
 		 351 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  71.64 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  70.43 
 
 		 346 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  70.43 
 
 		 346 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  68.42 
 
 		 354 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  71.09 
 
 		 354 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0621  serine/threonine protein kinase  67.14 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3582  serine/threonine protein kinase  65.6 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0435  serine/threonine protein kinase  55.68 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0421  serine/threonine protein kinase  56.51 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.083044  hitchhiker  0.000109607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  55.23 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  56.73 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0540  serine/threonine protein kinase  54.05 
 
 		 347 aa  359  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  55.82 
 
 		 340 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  53.85 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3069  serine/threonine protein kinase  54.47 
 
 		 343 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  53.89 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1287  serine/threonine protein kinase  53.94 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000310497  hitchhiker  0.00149361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  55.32 
 
 		 329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  54.62 
 
 		 342 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  55.52 
 
 		 346 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  55.52 
 
 		 346 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  55.52 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  55.22 
 
 		 343 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  55.22 
 
 		 343 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  55.22 
 
 		 343 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  55.22 
 
 		 343 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  56.25 
 
 		 329 aa  348  8e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  54.98 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  53.14 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  53.47 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3119  serine/threonine protein kinase  54.68 
 
 		 343 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2459  serine/threonine protein kinase  54.49 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3073  serine/threonine protein kinase  54.49 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  55.52 
 
 		 346 aa  342  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0552  serine/threonine protein kinase  54.08 
 
 		 360 aa  341  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3091  serine/threonine protein kinase  54.19 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  50.3 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688242  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  52.41 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  51.81 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  51.51 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  50.3 
 
 		 328 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  51.2 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  51.37 
 
 		 328 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000036631  hitchhiker  0.000000828535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  49.7 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  50.6 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  52.27 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  49.54 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  50.9 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  49.54 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  49.54 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  49.54 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  49.55 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000857443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  49.55 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  49.55 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  48.13 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4697  serine/threonine protein kinase  50.15 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  48.96 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  51.51 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 		 327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  47.85 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  46.81 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  47.59 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  49.08 
 
 		 355 aa  309  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  47.46 
 
 		 328 aa  309  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 		 351 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  49.09 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00403  serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 		 340 aa  308  9e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  48.79 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  51.04 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  47.6 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  47.9 
 
 		 328 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  46.2 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  45.91 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3574  serine/threonine protein kinase  46.13 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  46.2 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  47.72 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  48.33 
 
 		 328 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4349  serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  48.02 
 
 		 328 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  48.02 
 
 		 328 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  47.72 
 
 		 328 aa  299  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  48.02 
 
 		 328 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 		 328 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 		 328 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  47.72 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  0.0000791829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  47.72 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4331  serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4166  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0215875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  47.11 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0045  serine/threonine protein kinase  46.06 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4277  serine/threonine protein kinase  46.55 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>