132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3200 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 329 aa  688    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 		 528 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  27.02 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  25.5 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  23.02 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  24.68 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  25.21 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  25.55 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  25.11 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  25.1 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  23.53 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  22.07 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  24.29 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  23.62 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  23.66 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  23.57 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  23.02 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  24.55 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  22.81 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  22.79 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  23.44 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  23.51 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  23.96 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  24.56 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  24.1 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  25.09 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  23.3 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  23.3 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  26.23 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  28.04 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1613  serine/threonine protein kinase  22.09 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  22.11 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  24.34 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  23.17 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2860  aminoglycoside phosphotransferase  23.23 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  20.86 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  23.85 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  24.07 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  24.61 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  26.86 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3069  serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 		 343 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  28.68 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0552  serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2459  serine/threonine protein kinase  23.15 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3073  serine/threonine protein kinase  23.15 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  24.55 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  22.27 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  22.26 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0505  aminoglycoside phosphotransferase  22.91 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00132801  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3119  serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  23.87 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4384  serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.713425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  23.62 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  25.89 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4227  serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000275192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4277  serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4206  serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0481233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  22.89 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  22.85 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  23.02 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  20.18 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>