206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2085 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 528 aa  1101    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  51.66 
 
 		 337 aa  350  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  27.44 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 		 349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 		 329 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  28.98 
 
 		 327 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  30.88 
 
 		 327 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  43.56 
 
 		 1105 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 335 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 		 1178 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 1066 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 1043 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 1258 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  24.3 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 1406 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  24.92 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  24.11 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  24.65 
 
 		 323 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  24.65 
 
 		 323 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  26.77 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 930 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  24.58 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  24.11 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  27.7 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  24.19 
 
 		 323 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 1259 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 1484 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  23.21 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  26.04 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  23.81 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 752 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  27.18 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  24.19 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  24.48 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  23.29 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  23.86 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  26.05 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  24.2 
 
 		 323 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  24.37 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  24.58 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  26.12 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  26.12 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  26.12 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 555 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 555 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  32.05 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 547 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  26.27 
 
 		 356 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  28.97 
 
 		 561 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  31.63 
 
 		 560 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1162 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  22.73 
 
 		 317 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 709 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2914  histidine kinase  30.19 
 
 		 520 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.705646  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 765 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353109  normal  0.0193159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  24.17 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  26.96 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  30.15 
 
 		 567 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 904 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  23.17 
 
 		 333 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  23.03 
 
 		 321 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  23.26 
 
 		 321 aa  50.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  29.31 
 
 		 579 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 354 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  19.69 
 
 		 323 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  31.4 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  33.02 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 1741 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  31.43 
 
 		 910 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 1013 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  32.23 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1615  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 766 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0544593  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  26.21 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 660 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 816 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 		 318 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4407  histidine kinase  35.06 
 
 		 286 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.449221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1356 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 663 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  33.04 
 
 		 1374 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  31.4 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1058 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  21.4 
 
 		 327 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>