More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1030 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  85.55 
 
 
433 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  75.23 
 
 
429 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  71.43 
 
 
443 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  100 
 
 
431 aa  878    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  77.49 
 
 
431 aa  708    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  63.23 
 
 
431 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  63.77 
 
 
430 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  63.83 
 
 
436 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  63.59 
 
 
436 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  55.56 
 
 
431 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  48.02 
 
 
436 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  37.67 
 
 
437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  37.18 
 
 
434 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  38.58 
 
 
465 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.3 
 
 
428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  39.3 
 
 
448 aa  246  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  37.58 
 
 
465 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  35.45 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  37.1 
 
 
444 aa  242  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  37.44 
 
 
441 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  37.47 
 
 
432 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  35.65 
 
 
452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.72 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 
431 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  37.15 
 
 
441 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.41 
 
 
468 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.3 
 
 
440 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
454 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.03 
 
 
479 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
478 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
454 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  34.67 
 
 
450 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  36.43 
 
 
441 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
454 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.8 
 
 
454 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  34.95 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.85 
 
 
436 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  37.82 
 
 
395 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  35.15 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  35.76 
 
 
427 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  35.73 
 
 
443 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  37.2 
 
 
439 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 
448 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  35.37 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  35.41 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  34.42 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  33.64 
 
 
453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  30.77 
 
 
441 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  38.71 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  33.18 
 
 
434 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  31.41 
 
 
459 aa  212  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  35.06 
 
 
394 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  35.42 
 
 
435 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  33.94 
 
 
427 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  34.4 
 
 
442 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  34.92 
 
 
402 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  34.93 
 
 
396 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  33.01 
 
 
434 aa  209  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.28 
 
 
425 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  34.07 
 
 
419 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 
429 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  33.98 
 
 
468 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  34.28 
 
 
425 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  33.8 
 
 
432 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  34.28 
 
 
425 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.57 
 
 
458 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  33.66 
 
 
430 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  34.8 
 
 
432 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  35.11 
 
 
418 aa  207  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  33.97 
 
 
388 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  33.88 
 
 
427 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  33.64 
 
 
430 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  34.71 
 
 
464 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  34.75 
 
 
425 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  33.72 
 
 
437 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  35.44 
 
 
439 aa  206  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  32.3 
 
 
427 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  33.98 
 
 
403 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  33.88 
 
 
446 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  34.83 
 
 
463 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  36.08 
 
 
391 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.24 
 
 
389 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  34.55 
 
 
464 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  33.88 
 
 
429 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  33.49 
 
 
396 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  36.72 
 
 
386 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  34.22 
 
 
457 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  33.59 
 
 
421 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  33.73 
 
 
433 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  32.68 
 
 
471 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  32.57 
 
 
460 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 
390 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  33.73 
 
 
400 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.17 
 
 
401 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 
419 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>