More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0686 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  75.23 
 
 		 431 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  100 
 
 		 429 aa  869    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  74.83 
 
 		 431 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  74.88 
 
 		 433 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  79.29 
 
 		 443 aa  702    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  64.71 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  64.61 
 
 		 436 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  63.66 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  60 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  55.96 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  50.82 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  38.55 
 
 		 437 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  37.56 
 
 		 432 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  37.19 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.89 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.63 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.64 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.97 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  36.26 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  35.73 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  36.38 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  36.23 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  38.76 
 
 		 448 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.73 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.26 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  39.04 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  35.57 
 
 		 441 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.49 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.24 
 
 		 401 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  31.48 
 
 		 479 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  33.89 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  37.86 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.25 
 
 		 454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.4 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  36.61 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  35.04 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  34.01 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  33.11 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  36.89 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  35.35 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  36.89 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  32.56 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  33.72 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  34.79 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.02 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.2 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  37.22 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.54 
 
 		 399 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  32.43 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  37.33 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  34.42 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  38.12 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  35.56 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  34.15 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  35.48 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  35.12 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  32.35 
 
 		 388 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.89 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  35.28 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  34.78 
 
 		 421 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  29.95 
 
 		 459 aa  199  7e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  34.47 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  36.84 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  36.49 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.22 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  32.26 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  34.67 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  33.9 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.47 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.29 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  32.45 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  35.29 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  35.38 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  36.56 
 
 		 399 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  34.61 
 
 		 433 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  37.1 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  31.86 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.85 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  32.49 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.1 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  32.36 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.34 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>