More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1089 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 375 aa  763    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  57.49 
 
 		 376 aa  450  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  47.21 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  47.75 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  47.48 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  48.41 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  48.81 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  48.41 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  49.47 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  48.15 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  47.48 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  48.01 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  47.88 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  48.01 
 
 		 386 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 		 386 aa  361  9e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0858  acetylornithine aminotransferase  48.02 
 
 		 377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0057  acetylornithine aminotransferase  46.52 
 
 		 372 aa  325  6e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  44.44 
 
 		 379 aa  318  7.999999999999999e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.95 
 
 		 385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.68 
 
 		 387 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0540  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.56 
 
 		 412 aa  298  7e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.51 
 
 		 396 aa  295  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.64 
 
 		 396 aa  294  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  41.67 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.08 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  38.58 
 
 		 395 aa  289  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.19 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  42.33 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.05 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  41.27 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  40.85 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  41.25 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.51 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.51 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.41 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.47 
 
 		 397 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.76 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  40.92 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.92 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  40.58 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.95 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.92 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  40.92 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.92 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.51 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.87 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.65 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.92 
 
 		 406 aa  282  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.59 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  40.59 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  41.95 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  40.9 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.48 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1254  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.82 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.63 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 		 399 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.78 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 		 398 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  39.9 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  39.05 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  38.95 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.21 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52948  acetylornithine aminotransferase  40.77 
 
 		 452 aa  275  7e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.346975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.21 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  39.06 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.1 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  39.27 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  39.06 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.25 
 
 		 387 aa  272  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1415  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.65 
 
 		 408 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.34 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  38.38 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1398  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.38 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2043  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.38 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  36.72 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.84 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1430  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.38 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.82 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  38.74 
 
 		 395 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.36 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  41.05 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.63 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  38.13 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1871  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.11 
 
 		 408 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  38.24 
 
 		 403 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  37.86 
 
 		 402 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.36 
 
 		 397 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  39.1 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  39.31 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  38.38 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  36.62 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  37.24 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>