More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1254 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1254  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
394 aa  807    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0875  aminotransferase class-III  59.29 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.171491  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0717  acetylornithine aminotransferase  51.43 
 
 
386 aa  402  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0925  acetylornithine aminotransferase  49.48 
 
 
387 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1387  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
387 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0540  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.19 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  43.21 
 
 
396 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.12 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.19 
 
 
387 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.11 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  41.77 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.42 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.22 
 
 
394 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  41.56 
 
 
386 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  40.82 
 
 
395 aa  292  6e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  42.16 
 
 
386 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  41.43 
 
 
395 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  42.39 
 
 
394 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  41.58 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  41.88 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  40.77 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.73 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.22 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  39.37 
 
 
391 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
375 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  41.18 
 
 
395 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.8 
 
 
399 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  38.32 
 
 
423 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.8 
 
 
397 aa  279  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  39.35 
 
 
396 aa  278  8e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  40.93 
 
 
396 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.19 
 
 
397 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.32 
 
 
399 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.73 
 
 
396 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  38.44 
 
 
390 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.78 
 
 
396 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  39.39 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  38.29 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.17 
 
 
397 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 
400 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.97 
 
 
404 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.02 
 
 
396 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.04 
 
 
414 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.04 
 
 
414 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  40.5 
 
 
393 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.95 
 
 
396 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.21 
 
 
417 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.04 
 
 
446 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  41.15 
 
 
376 aa  271  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  40.4 
 
 
420 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.16 
 
 
399 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.73 
 
 
396 aa  270  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  37.66 
 
 
426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  37.37 
 
 
418 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  37.37 
 
 
418 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  38.89 
 
 
398 aa  268  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.85 
 
 
395 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  38.08 
 
 
395 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.76 
 
 
386 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.32 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  39.45 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.96 
 
 
406 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
386 aa  266  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37 
 
 
413 aa  265  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.35 
 
 
398 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.42 
 
 
446 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  38.44 
 
 
401 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.96 
 
 
420 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.75 
 
 
408 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.5 
 
 
408 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  37.41 
 
 
427 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  39.28 
 
 
386 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.71 
 
 
406 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  39.75 
 
 
386 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.71 
 
 
406 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.8 
 
 
406 aa  262  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.47 
 
 
406 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  37.98 
 
 
399 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.71 
 
 
406 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  37.8 
 
 
406 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  37.8 
 
 
406 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0686  acetylornithine transaminase protein  36.73 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.8 
 
 
406 aa  262  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.8 
 
 
406 aa  262  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.8 
 
 
406 aa  262  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  36.48 
 
 
418 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.32 
 
 
405 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  38.42 
 
 
395 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  36.73 
 
 
393 aa  262  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.32 
 
 
405 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0774  acetylornithine transaminase protein  36.73 
 
 
411 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.94 
 
 
397 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.43 
 
 
405 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  36.29 
 
 
422 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.8 
 
 
406 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.59 
 
 
406 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.46 
 
 
406 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.2 
 
 
389 aa  259  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>