More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0875 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0875  aminotransferase class-III  100 
 
 
395 aa  802    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.171491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1254  acetylornithine aminotransferase  59.29 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1387  acetylornithine aminotransferase  54.59 
 
 
387 aa  420  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0925  acetylornithine aminotransferase  54.69 
 
 
387 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0717  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
386 aa  384  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.82 
 
 
394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 
402 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  44.67 
 
 
396 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  47.12 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0540  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.67 
 
 
412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.08 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.24 
 
 
395 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.71 
 
 
401 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  45.29 
 
 
395 aa  290  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.56 
 
 
394 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  44.18 
 
 
385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.28 
 
 
400 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
400 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
400 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  41.3 
 
 
396 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  40.66 
 
 
422 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  43.92 
 
 
385 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.89 
 
 
396 aa  279  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.12 
 
 
399 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  41.27 
 
 
426 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  40.5 
 
 
423 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  40.46 
 
 
396 aa  275  8e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  38.23 
 
 
397 aa  272  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  42.2 
 
 
403 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  41.01 
 
 
398 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  40.66 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  40.66 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.53 
 
 
417 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.33 
 
 
396 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.25 
 
 
420 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.58 
 
 
385 aa  266  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  40.3 
 
 
398 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.25 
 
 
427 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.66 
 
 
397 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  38.23 
 
 
418 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  38.9 
 
 
401 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  38.11 
 
 
427 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.44 
 
 
397 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.57 
 
 
446 aa  262  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  40.45 
 
 
394 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.4 
 
 
397 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  38.24 
 
 
390 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 
398 aa  259  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 
386 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.21 
 
 
396 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  39.43 
 
 
391 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.94 
 
 
397 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.22 
 
 
395 aa  256  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.21 
 
 
396 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.39 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.27 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  39.54 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  39.02 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  37.66 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  39.14 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  40.57 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  40.52 
 
 
394 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  40.52 
 
 
394 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  39.64 
 
 
386 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  40.52 
 
 
394 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  40.41 
 
 
399 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.63 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  37.5 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  37.91 
 
 
403 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  39.59 
 
 
434 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  39.37 
 
 
388 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  40.52 
 
 
394 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  37.02 
 
 
391 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  38.25 
 
 
393 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  38.21 
 
 
420 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.44 
 
 
399 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  39.21 
 
 
394 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
417 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1534  acetylornithine aminotransferase  38.01 
 
 
394 aa  249  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.719069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  38.28 
 
 
404 aa  249  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
379 aa  249  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.73 
 
 
396 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  37.34 
 
 
393 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  38.96 
 
 
386 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  37.7 
 
 
404 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  37.73 
 
 
402 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
396 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.5 
 
 
394 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.72 
 
 
406 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  39.48 
 
 
394 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  39.28 
 
 
417 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  41.24 
 
 
376 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  38.44 
 
 
402 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  36.6 
 
 
395 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  38.46 
 
 
394 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3149  acetylornithine aminotransferase  35.99 
 
 
402 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.457305 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  36.91 
 
 
401 aa  246  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>