More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3139 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  88.07 
 
 		 394 aa  727    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  80.51 
 
 		 399 aa  658    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  86.55 
 
 		 394 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  88.07 
 
 		 394 aa  727    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  86.29 
 
 		 394 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  81.07 
 
 		 395 aa  661    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  78.68 
 
 		 395 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  86.55 
 
 		 394 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  86.55 
 
 		 394 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  88.58 
 
 		 394 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  86.29 
 
 		 394 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  81.07 
 
 		 395 aa  661    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  90.86 
 
 		 394 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  86.29 
 
 		 394 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  86.29 
 
 		 510 aa  695    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  96.19 
 
 		 394 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  86.29 
 
 		 394 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  87.82 
 
 		 394 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  87.06 
 
 		 394 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  88.32 
 
 		 394 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  87.82 
 
 		 394 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 		 394 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  78.17 
 
 		 395 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  73.63 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  73.37 
 
 		 397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  69.82 
 
 		 395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  60.84 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  60.05 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  53.23 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.25 
 
 		 398 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  45.14 
 
 		 398 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  46.61 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  46.35 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  44.25 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  46.17 
 
 		 426 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  45.31 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.34 
 
 		 399 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  44.36 
 
 		 393 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.6 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.18 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.36 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  43.19 
 
 		 385 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.78 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.22 
 
 		 395 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.28 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.44 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.9 
 
 		 396 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 		 395 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.49 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.01 
 
 		 395 aa  295  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.64 
 
 		 399 aa  295  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  43.16 
 
 		 403 aa  295  7e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  44.08 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  40.97 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  44.33 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.15 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.88 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.24 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  44.1 
 
 		 399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  41.34 
 
 		 418 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.8 
 
 		 427 aa  289  5.0000000000000004e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  43.49 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  41.88 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  41.88 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 		 427 aa  289  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.88 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.62 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.62 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.62 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  39.84 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  39.5 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.62 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.36 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.93 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 		 397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  43.56 
 
 		 397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  39.58 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.91 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.95 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  39.3 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.44 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  40.1 
 
 		 391 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  38.62 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  38.62 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.47 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.22 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0611  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.26 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.894863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3419  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.26 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0610  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.26 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0636462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  40.15 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  39.43 
 
 		 386 aa  275  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0645  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.26 
 
 		 405 aa  276  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>