More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0402 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  96.01 
 
 
426 aa  819    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  95.54 
 
 
426 aa  815    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  91.78 
 
 
426 aa  790    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  100 
 
 
426 aa  855    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  69.81 
 
 
427 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  66.07 
 
 
398 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  65.3 
 
 
393 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04730  Ornithine/acetylornithine aminotransferase  62.47 
 
 
383 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  51.84 
 
 
397 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  50.9 
 
 
398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  48.47 
 
 
395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  46.55 
 
 
395 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  46.09 
 
 
394 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  46.55 
 
 
395 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  45.31 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  46.11 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  45.85 
 
 
395 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  46.7 
 
 
394 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  46.7 
 
 
394 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  46.7 
 
 
394 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  46.7 
 
 
394 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  46.7 
 
 
394 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  46.7 
 
 
394 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  46.7 
 
 
394 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  45.91 
 
 
394 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  45.91 
 
 
394 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  45.38 
 
 
394 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  45.41 
 
 
394 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  46.92 
 
 
397 aa  322  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  46.3 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  44.59 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  44.97 
 
 
510 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  46.11 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  42.67 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
398 aa  306  6e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  43.56 
 
 
398 aa  303  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.75 
 
 
385 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.04 
 
 
398 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
394 aa  292  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 
385 aa  286  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 
396 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.36 
 
 
395 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  39.49 
 
 
394 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.23 
 
 
399 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.27 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.69 
 
 
399 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
399 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.05 
 
 
417 aa  269  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.45 
 
 
396 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 
395 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.52 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  41.06 
 
 
402 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.71 
 
 
406 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  37.82 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.65 
 
 
427 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.55 
 
 
397 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.26 
 
 
395 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 
406 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 
406 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.8 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0484  succinylornithine transaminase family  42.39 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.77 
 
 
406 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  39.36 
 
 
418 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.72 
 
 
406 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  36.79 
 
 
396 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  38.89 
 
 
403 aa  252  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.72 
 
 
406 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  41.03 
 
 
400 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
397 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 
406 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.44 
 
 
387 aa  248  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.76 
 
 
396 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
423 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.14 
 
 
387 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.82 
 
 
405 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.82 
 
 
405 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.82 
 
 
405 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  37.28 
 
 
427 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  39.79 
 
 
405 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.97 
 
 
405 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.56 
 
 
405 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.36 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3516  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.92 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  38.58 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  38.68 
 
 
426 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.5 
 
 
404 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.62 
 
 
406 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  41.96 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  40 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0655  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.52 
 
 
405 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000579113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  40.97 
 
 
399 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0617  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 
405 aa  243  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  40.67 
 
 
396 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.53 
 
 
408 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.53 
 
 
405 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>