More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5164 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  100 
 
 
427 aa  865    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  70.16 
 
 
426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  70.02 
 
 
426 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  69.81 
 
 
426 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  69.67 
 
 
426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  66.07 
 
 
398 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  65.55 
 
 
393 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04730  Ornithine/acetylornithine aminotransferase  59.42 
 
 
383 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  48.46 
 
 
397 aa  359  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  47.29 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  45.62 
 
 
395 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  45.21 
 
 
395 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  45.21 
 
 
395 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  44.85 
 
 
394 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 
394 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  44.41 
 
 
395 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  44.41 
 
 
395 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  43.01 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  43.95 
 
 
399 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  43.92 
 
 
397 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  43.8 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  43.8 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  43.8 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  43.8 
 
 
394 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  43.8 
 
 
394 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  43.8 
 
 
394 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  43.8 
 
 
394 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  40.93 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  42.22 
 
 
394 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  41.95 
 
 
394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  43.5 
 
 
394 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  42.74 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  42.74 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  41.69 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  43.39 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  41.69 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  43.54 
 
 
510 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
385 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  40.26 
 
 
398 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 
398 aa  285  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  39.79 
 
 
395 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 
394 aa  272  9e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.22 
 
 
399 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 
395 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.87 
 
 
399 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  38.82 
 
 
396 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.86 
 
 
399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  41.15 
 
 
402 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.12 
 
 
399 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.64 
 
 
396 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  36.55 
 
 
385 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.48 
 
 
397 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 
395 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
417 aa  260  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.53 
 
 
398 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 
397 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  35.77 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.31 
 
 
406 aa  253  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.03 
 
 
387 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  38.04 
 
 
418 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.47 
 
 
396 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.21 
 
 
406 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  39.04 
 
 
399 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  34.6 
 
 
396 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.21 
 
 
406 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.7 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.7 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  36.74 
 
 
427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.47 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0484  succinylornithine transaminase family  39.49 
 
 
406 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.81 
 
 
427 aa  243  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  38.68 
 
 
400 aa  243  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  38.95 
 
 
391 aa  243  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.18 
 
 
406 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  40.27 
 
 
390 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.69 
 
 
406 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  39.42 
 
 
391 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  38.07 
 
 
403 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.78 
 
 
406 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0636  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  35.64 
 
 
403 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  36.08 
 
 
404 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  36.48 
 
 
426 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  40.63 
 
 
422 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3193  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.76 
 
 
405 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.18 
 
 
404 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  37.18 
 
 
400 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  38.79 
 
 
399 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3516  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.99 
 
 
405 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  38.7 
 
 
396 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.39 
 
 
397 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.84 
 
 
403 aa  235  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.6 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0163  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.69 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3299  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.5 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.67 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  40.92 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>