More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4830 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  91.08 
 
 		 426 aa  782    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  90.14 
 
 		 426 aa  775    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  91.78 
 
 		 426 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  100 
 
 		 426 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  69.67 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  66.5 
 
 		 398 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  65.23 
 
 		 393 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04730  Ornithine/acetylornithine aminotransferase  62.08 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  51.58 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  51.16 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  48.59 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  47.15 
 
 		 395 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  46.97 
 
 		 394 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  46.17 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  47.15 
 
 		 395 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  46.17 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  46.28 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  45.88 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  46.17 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  45.88 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  45.38 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  46.44 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  45.65 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 		 394 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  44.59 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  45.79 
 
 		 399 aa  316  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  41.71 
 
 		 405 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.62 
 
 		 398 aa  312  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  44.81 
 
 		 510 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  42.89 
 
 		 398 aa  305  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.93 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.57 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.64 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.67 
 
 		 385 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.98 
 
 		 399 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.96 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  38.76 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.21 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.35 
 
 		 417 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 		 396 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  39.12 
 
 		 395 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 385 aa  273  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 		 399 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.35 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  41.38 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.54 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  40.44 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.86 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.82 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.9 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40.83 
 
 		 400 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.48 
 
 		 427 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  36.79 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.74 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.51 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.98 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.28 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.51 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.28 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.31 
 
 		 406 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  40.83 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.26 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.46 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  39.02 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  41.3 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  38.48 
 
 		 427 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.79 
 
 		 406 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.01 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.29 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  37.72 
 
 		 418 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  37.82 
 
 		 418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.12 
 
 		 406 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  40.31 
 
 		 405 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  40.32 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  40.62 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  41.43 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.9 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  42.55 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.29 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.23 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  38.82 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0578  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.05 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  37.66 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  39.28 
 
 		 395 aa  243  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  39.51 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>