More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1612 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  100 
 
 
405 aa  836    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  55.26 
 
 
397 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  55.41 
 
 
395 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  54.26 
 
 
394 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  54.15 
 
 
394 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  54.4 
 
 
394 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  53.37 
 
 
394 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  53.37 
 
 
394 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  54.29 
 
 
395 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  53.37 
 
 
394 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  53.63 
 
 
394 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  53.63 
 
 
394 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  53.37 
 
 
394 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  53.63 
 
 
394 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  53.23 
 
 
394 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  54.69 
 
 
395 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  53.37 
 
 
394 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  53.37 
 
 
394 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  54.69 
 
 
395 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  53.37 
 
 
394 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  53.11 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  54.12 
 
 
395 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  53.09 
 
 
399 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  52.07 
 
 
394 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  52.07 
 
 
394 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  52.85 
 
 
510 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  53.23 
 
 
397 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  52.97 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  50.13 
 
 
398 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  47.14 
 
 
398 aa  378  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  46.74 
 
 
398 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  46.09 
 
 
398 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.94 
 
 
396 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  48.04 
 
 
394 aa  358  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 
402 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.81 
 
 
394 aa  348  9e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.72 
 
 
417 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  45.09 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.91 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  47.62 
 
 
400 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  45.92 
 
 
395 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  44.75 
 
 
397 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  44.75 
 
 
397 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  42.04 
 
 
398 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  44.64 
 
 
395 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  40.6 
 
 
396 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  41.78 
 
 
393 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  44.01 
 
 
396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.36 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  44.9 
 
 
395 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.6 
 
 
399 aa  318  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  40.73 
 
 
385 aa  319  7e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  42.53 
 
 
426 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.35 
 
 
399 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.39 
 
 
399 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  43.43 
 
 
403 aa  317  3e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  42.71 
 
 
426 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.21 
 
 
385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.36 
 
 
399 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  42.67 
 
 
426 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  41.71 
 
 
426 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.95 
 
 
400 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.85 
 
 
399 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.04 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.55 
 
 
396 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.4 
 
 
397 aa  309  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.81 
 
 
398 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.64 
 
 
398 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.39 
 
 
406 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  41.81 
 
 
396 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.36 
 
 
395 aa  299  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
418 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.11 
 
 
403 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.64 
 
 
403 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.14 
 
 
406 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
411 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.02 
 
 
401 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  40.26 
 
 
403 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  39.25 
 
 
405 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.58 
 
 
403 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.75 
 
 
405 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.55 
 
 
406 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.6 
 
 
406 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.29 
 
 
406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.12 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  40.93 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0163  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.27 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.12 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.12 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.73 
 
 
405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  40.67 
 
 
423 aa  282  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.12 
 
 
406 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.73 
 
 
404 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
388 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  40.67 
 
 
391 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2733  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.8 
 
 
404 aa  279  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0655  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.3 
 
 
405 aa  279  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000579113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  40.2 
 
 
395 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  39.24 
 
 
426 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.17 
 
 
406 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>